Государством гарантируется свобода вероисповедания. Религиозные институты отделены от государства.

Традиционной религией является восточно-православное христианство (85% населения). Православное христианство с IX в. является главной религией страны. Сегодня его исповедует 82,6% жителей. На протяжении всей истории Болгарии оно играло важную роль в формировании нации. Во времена иноземного владычества благодаря православной церкви болгары сумели сохранить свой родной язык, а во многом и культуру. Церковь является автокефальной (административно самостоятельной). Ею управляет болгарский патриарх. Службы ведутся на болгарском языке.

В Болгарии есть также представители армянской православной церкви. Большинство из них — беженцы, прибывшие сюда в начале XX в., в период геноцида армян в Турции.

Ислам исповедует 13% граждан. Ислам появился на Балканах в период турецкого владычества на Балканах. Турецкие власти насаждали свою веру; они строили мечети, превращали церкви в места поклонения мусульман. После того как Болгария обрела независимость, многие мечети были вновь перестроены в православные храмы и обрели тем самым свое первоначальное предназначение.

Сегодня в стране насчитывается около 713 тыс. мусульман турецкого происхождения. Они проживают в основном в северо-восточной части страны и на границе с Турцией. Также мусульманами являются помаки (131 тыс. чел.) — потомки этнических болгар, насильно обращенные в ислам в XV в., и цыгане (103 тыс. чел.). Кроме того, ислам исповедуют потомки татар и знаменитые черкесы, в XIX в. сбежавшие из российской армии, продвигавшейся на Кавказ (20 тыс. чел.).

Болгарские мусульмане в большинстве своем принадлежат к ветви суннитов, хотя есть и шииты (около 80 тыс. человек).

В последние годы в Болгарии активизировалась деятельность католической и других конфессий, а также различных сект. В Болгарии насчитывается около 44 тыс. католиков (0,6% населения страны). Действует болгарская униатская церковь. В крупных болгарских городах можно увидеть католические соборы.

Первые католики, появившиеся в Болгарии, были приезжими купцами и рудокопами (XIV в.). В XVI—XVII вв. католическую веру принимали павликяне (потомки еретиков богомилов). В 1860 г. группа болгар, живших в Константинополе, была принята в лоно римской церкви.

В Болгарии существует Еврейская община уже на протяжении последних двух тысячелетий. В Средние века евреи из Центральной Европы селились на болгарских землях. Во времена существования Оттоманской империи страна предоставляла убежище многим еврейским общинам, изгнанным из Испании в период правления Католических королей. Во многих болгарских городах — в Софии, Самокове, Пловдиве, Видине и др. — построены синагоги.

В Болгарии есть также протестанты, методисты, баптисты, пятидесятники и адвентисты.